Ensemble des micro-organismes (bactéries, levures, virus) hébergés dans le tube digestif, principalement le côlon, et vivant en symbiose avec l'hôte. Il participe à la digestion des fibres, à la synthèse de certaines vitamines, à la maturation du système immunitaire et à la protection de la barrière intestinale. Un déséquilibre de sa composition, appelé dysbiose, est associé à divers troubles digestifs et métaboliques.
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